适合耳穴治疗的疾病有很多，大体有以下几类：（1）各种疼痛性疾病：如外伤、手术、炎症、肿瘤等引起的疼痛；（2）各种炎症性疾病：如急性结合膜炎、电光性眼炎、牙周炎、中耳炎、咽喉炎、扁桃体炎、气管炎、胃炎、肠炎、阑尾炎、附件炎、盆腔炎、宫颈炎、睾丸炎、风湿性关节炎、末梢神经炎等；（3）变态反应性疾病及胶原组织性疾病：过敏性鼻炎、过敏性哮喘、过敏紫癜、过敏性肠炎、结节性红斑、风湿热、药物疹、红斑狼疮等疾病；（4）内分泌代谢及泌尿生殖系统等疾病：单纯性甲状腺肿、急性甲状腺炎、甲状腺机能亢进、糖尿病、肥胖病、尿崩症、垂体瘤等，可调节改善症状，减少用药量等；（5）功能性疾病：内耳眩晕症（美尼尔氏综合症）、心律不齐、高血压、多汗症、性功能障碍、面肌痉挛、神经衰弱、植物神经功能紊乱、月经不调、痛经、内分泌紊乱、功能性子宫出血等疾病。（6）各种慢性疾病：腰腿痛、颈椎病、肩背部肌纤维炎、肩周炎、迁延性肝炎、脑震荡及脑外伤后遗症、慢性胆囊炎、慢性胃炎、十二指肠溃疡等；（7）传染性疾病：流感、百日咳、猩红热、疟疾、肺结核、菌痢、传染性肝炎、扁平疣、腮腺炎等；（8）其他：耳穴治疗尚有催产、催乳、戒烟、解毒、解酒，治疗食物中毒、治疗竞技综合症，预防输液反应，预防治疗晕车、晕船，预防感冒，并有保健、美容、减肥、排石等作用。耳穴治疗适应症广泛。许多疾病可单独用耳穴治疗，有的疾病耳穴治疗为辅助手段。
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